中期退课会造成课程资源浪费
了解到世界一流大学在学分制运行中的做法后，北大于2004年开始收取退课资源补偿费，规则如下：
中期退课：允许学生在学期中期（第八周）网上退课，并按100元/学分缴纳延期退课资源补偿费。为避免可能出现的问题，退课手续不允许他人代办，逾期不再受理。
北京大学是公立大学，学生缴纳的学费和财政经费（来源于税收）分担生均成本，每一课程学分的成本也可以视为由学费收入和财政拨款组成，但来自学费的比例很小。学生如果因为中期退课而导致其他学生无法进入选修，就会造成财政经费的浪费。
从理论上讲，学生应该对被浪费的财政经费有所补偿，其应该补偿的经费就是退课资源补偿费，简称退课费。由于北京大学财政拨款较多，学分成本很高，因此从理论上判断，学生如果造成了财政经费的浪费，其额度相对其他一般高校会更多，其补偿的经费应该是学分学费几倍之多。
打一个比方，假设甲方为学生，乙方为政府财政，甲乙双方决定共同出资经营饭店，其中甲方出资25%，乙方出资75%。饭店经营了几个月，甲方说我很累，不干了，乙方的75%出资就会被白白浪费掉。这是合理的吗？从这个假设看，假设甲方自己出资100%经营饭店（相当于以学费全额负担教育成本），甲方说我很累，不干了，浪费的只是自己的投入，这可能是合理的。
北京大学将退课费定价为100元/学分，实际很低，仅仅具有象征意义，其目标只是在管理上使得学生具有基本的成本意识，并未完全实现要求退课学生补偿所浪费的课程成本。因此，退课费在其本质上也非常类似一种杂费。这是国情和学校情况相结合的本土化产物了。
退课费是北京大学2004年在学分制实际运行中，根据国情和北京大学的实际情况所建立的保证学分制顺利运行的一项收费，过去12年来得到了同学们的理解，保证了学校学分制运行的教学秩序。
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